Rのパッケージ管理方法についてまとめます
初期設定
Rの本体は apt でインストール，必要なパッケージは自前でビルド＆インストールする方法がおすすめです
本体のインストール
$ sudo apt install r-base-core
追加インストールするライブラリは $(HOME)/local/R 以下に配置します．これで root権限が不要になります．
設定は ~/.Renviron を用意して，いかのように設定を書きます
R_USER=~/local/R R_LIBS_USER=~/local/R/lib
パッケージのインストール
Rを起動して
install.package("パッケージ名")
パッケージの自動更新
ここからが本題です
インストール済みのパッケージを更新する場合
Rを起動して
>|r
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE, lib.loc=Sys.getenv("R_LIBS_USER"))
|
未インストールのパッケージのみ自動インストール
以下のRのコードで，未インストールのパッケージのみが自動インストールされます
L <- c("lme4") L <- append(L, c("lmtest", "stargazer")) L <- L[!(L %in% installed.packages()[,"Package"])] if (length(L)) { install.packages(L) }
これで，必要なパッケージを変数Lのリストに登録しておいて，インストール済みのパッケージはリストLから除外して，リストLにあるパッケージを install.pacakges() でインストールという流れになります
ちなみに
